Les données centralisées par l’Observatoire, contribuent directement à l’évaluation des Aires Marines Protégées, du Bon Etat des Écologique des oiseaux marins dans le cadre de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) et aux rapportages Natura 2000 (Directive Oiseaux). Elles répondent également aux engagements internationaux pour la protection du milieu marin, tels que la Convention de Barcelone pour le littoral méditerranéen et la Convention OSPAR pour la façade Atlantique Nord-Est en alimentant des indicateurs de ces Conventions de Mers régionales (CMR).